第一碟：本片＋特别收录

•  「虚拟水族箱」：您可以利用影片中多种美丽的海底世界画面，将家中的电视机变成各类虚拟水族箱。 
•  独家收录迪斯尼／皮克斯2004年最新计算机动画电影『超人特攻队』精采预告片，让您先睹为快！ 
•  「随片视觉讲评」：本片幕后制作小组为您提供详尽的影像讲评，其中包括首度曝光的漏网片段和充满趣味的精彩内幕！ 
•  还有更多的惊喜，等您来发掘！ 

第二碟：特别收录

•  「鱼猜谜游戏：超级比一比」：和活泼可爱的鱼群一起进行刺激好玩的「超级比一比」，挑战您的想象力和理解力！ 
•  「探索珊瑚礁」：世界知名的海洋探险家带您到澳洲大堡礁探索珊瑚礁生态的秘密，不速之客多莉、马林和尼莫也来参一脚喔！ 
•  「雷老师的百科全书」： 带您认识多采多姿的海洋生物，学习更多丰富的知识！ 
•  「说故事时间」：家中小小朋友的最爱！ 
•  「海底总动员」制作过程：让您了解制作本片的乐趣和挑战！ 
•  「参观皮克斯片厂」：带您一窥这个充满创意与梦想的动画创作天地，让您大开眼界！ 
•  「虚拟水族箱」：更多首度曝光的画面，让您可以将家中的电视机变成各类虚拟水族箱。 
•  收录皮克斯计算机动画短片「小雪人大行动」 
•  收录片中角色访问、创意设计画廊…等。 
•  还有更多的惊喜，等您来发掘！

    《海底总动员》的主角是一对可爱的小丑鱼(Clownfish)父子。父亲玛林和儿子尼莫一直在澳洲外海大堡礁中过着安定而"幸福"的平静生活。鱼爸爸玛林一直谨小慎微，行事缩手缩脚，虽然已经身为人父，却丝毫不会影响它成为远近闻名的胆小鬼。也正因为这一点，儿子尼莫常常与玛林发生争执，甚至有那么一点瞧不起自己的父亲。直到有一天，一直向往到海洋中冒险的尼莫，游出了他们所居住的珊瑚礁。正当尼莫想要舒展一下小尾巴的时候，一艘渔船毫不留情地将欢天喜地的尼莫捕走，并将它辗转卖到澳洲悉尼湾内的一家牙医诊所。

    在大堡礁的海底，心爱的儿子突然生死未卜的消息，对于鱼爸爸玛林来说却无异于晴天霹雳。尽管胆小尽管怕事，现在为了救回心爱的孩子，玛林也就只有豁出去了。它决心跟上澳洲洋流，踏上寻找自己儿子的漫漫征程。
 
    虽说是下定决心，但这并不代表玛林可以在一夜之间抛弃自己怯懦的性格。途中与大白鲨布鲁斯的几次惊险追逐，很快便令它萌生退意，险些使父子重聚的希望化为泡影。但幸运的是，玛林遇到了来自撒马力亚(Samaritan)的蓝唐王鱼(Regal Blue Tang)多瑞(Dory)。多瑞是一只热心助人、胸怀宽广的大鱼。虽然严重的健忘症常常搞得玛林哭笑不得，但是有多瑞在身边做伴，却也渐渐令玛林明白了如何用勇气与爱战胜自己内心的恐惧，也懂得了一生中有一些事情的确是值得自己去冒险去努力的道理。

    就这样，两条鱼在辽阔的太平洋上的冒险使它们交到了形形色色的朋友，也遭遇了各式各样的危机。而鱼爸爸玛林也终于克服万难，与儿子团聚并安全地回到了自己的家乡。过去那个甚至连自己儿子都瞧不起的胆小鬼玛林，经过这次的考验后成为了儿子眼中真正的英雄！一场亲情团聚的大戏，就此在充满泪水的眼睛中落下了帷幕。