影片一开始就将观众带到一个紧张的情节之中：一帮恐怖分子占领了艾菲尔铁塔，扬言要用氢弹炸掉它，以此来要挟法国政府答应他们的要求。而超人爱慕的女记者路易斯·拉娜更是为了能够获得普利策奖而不顾危险，深入虎穴，情况十分危急。又一次，超人及时赶到，从坠落的电梯下救出了路易斯，并将载有氢弹的电梯运送到了外太空，从而拯救了巴黎。
氢弹在远离地球的太空中爆炸了，不幸的是，爆炸将超人第一部最后被囚禁起来的三个坏蛋释放了出来。他们来到了地球，并妄图统治这个美丽的星球。
平安归来的路易斯与克拉克一起来到尼亚加拉大瀑布采访，在早已怀疑超人就是克拉克的路易斯面前，克拉克终于坦白了自己的真实身份。为了能与深爱的女子共度一生，超人不顾母亲的劝告，心甘情愿地牺牲了自己的超能力，变成了一名普通人。
以萨德为首的三个坏蛋来到地球，凭借着自己的超能力恣意妄为，他们闯入白宫，逼迫政府和总统投降。 而此时，在一家快餐店里，已是凡人的克拉克不幸和流氓发生了冲突，克拉克生平第一次被打倒在地，看着电视机里传来的总统求助的画面与萨德嚣张的气焰，克拉克前所未有地感受到自己所担负的责任重大。于是克拉克离开路易斯回到北极，在绿色水晶的帮助下恢复了超能力，并最终战胜了三个坏蛋，捍卫了地球的和平。
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